Álgebra Geométrica Conforme aplicada à atualização de estruturas 3D de proteínas
Resumo
Proteínas são macromoléculas muito importantes para os organismos vivos, pois estão presentes em diversos processos biológicos essenciais, como transporte de substâncias, defesa do organismo, entre muitos outros [1]. O formato tridimensional de uma proteína está intrinsecamente relacionado à sua função. É comum em química computacional a necessidade de calcular diversas vezes a atualização da estrutura 3D de uma proteína [2]. Por isso, nosso objetivo é estudar como a Álgebra Geométrica (AG) pode ser utilizada lidar com mudanças conformacionais de proteínas. [...]
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Referências
David Nelson e Michael Cox. Principles of Biochemistry. W.H. Freeman, New York, 2008.
Vicky Choi. “On updating torsion angles of molecular conformations”. Em: Journal of chemical, information and modeling, ACS Publications 46.1 (2006), pp. 438–444.
Kenichi Kanatani. Understanding Geometric Algebra: Hamilton, Grassmann, and Clifford for Computer Vision and Graphics. AK Peters/CRC Press, 2015.
Jesus Marcos Camargo. “Geometria de proteínas no espaço conforme”. Tese de doutorado. Campinas: Universidade Estadual de Campinas, 2021.
Alysson Matos de Souza. “Álgebra Geométrica Conforme aplicada à atualização de estruturas 3D de proteínas”. Dissertação de mestrado. Campinas: Universidade Estadual de Campinas, 2023.
Irina Kufareva e Ruben Abagyan. “Methods of protein structure comparison”. Em: Methods Mol Biol 857 (2012), pp. 231–257.
